Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HmgcrQ01237 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmgcrQ01237 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms