Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grin2bQ01097 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms