Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga4Q00651 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms