Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pou1f1Q00286 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms