Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Atp9bP98195 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Atp9bP98195 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Atp9bP98195 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Atp9bP98195 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp9bP98195 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms