Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab33aP97950 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33aP97950 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33aP97950 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33aP97950 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33aP97950 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33aP97950 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33aP97950 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab33aP97950 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33aP97950 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33aP97950 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33aP97950 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33aP97950 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33aP97950 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33aP97950 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33aP97950 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33aP97950 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab33aP97950 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab33aP97950 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab33aP97950 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms