Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lama4P97927 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama4P97927 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lama4P97927 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms