Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms