Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ptprn2P80560 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms