Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ldb1P70662 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ldb1P70662 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ldb1P70662 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ldb1P70662 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ldb1P70662 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb1P70662 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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