Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp9xP70398 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp9xP70398 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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