Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad50P70388 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad50P70388 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rad50P70388 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Rad50P70388 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rad50P70388 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms