Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxb13P70321 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms