Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sycp3P70281 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sycp3P70281 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms