Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plxna3P70208 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms