Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Traf5P70191 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms