Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntn5P68500 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms