Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm6P62313 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm6P62313 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm6P62313 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm6P62313 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm6P62313 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm6P62313 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm6P62313 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm6P62313 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lsm6P62313 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm6P62313 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms