Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdo1P60334 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdo1P60334 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms