Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp4P59240 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms