Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdrg1P59048 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms