Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snrpa1P57784 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snrpa1P57784 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms