Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp25P57080 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp25P57080 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp25P57080 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp25P57080 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp25P57080 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Usp25P57080 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Usp25P57080 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Usp25P57080 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Usp25P57080 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp25P57080 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp25P57080 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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