Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bace1P56818 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bace1P56818 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms