Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
SmoP56726 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SmoP56726 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SmoP56726 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SmoP56726 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SmoP56726 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SmoP56726 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SmoP56726 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SmoP56726 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SmoP56726 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SmoP56726 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SmoP56726 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SmoP56726 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SmoP56726 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SmoP56726 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SmoP56726 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SmoP56726 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SmoP56726 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SmoP56726 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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SmoP56726 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SmoP56726 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SmoP56726 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SmoP56726 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmoP56726 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmoP56726 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmoP56726 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmoP56726 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmoP56726 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SmoP56726 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SmoP56726 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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