Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rp1P56716 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rp1P56716 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rp1P56716 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rp1P56716 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rp1P56716 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rp1P56716 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rp1P56716 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rp1P56716 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rp1P56716 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rp1P56716 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rp1P56716 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rp1P56716 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rp1P56716 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rp1P56716 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rp1P56716 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rp1P56716 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rp1P56716 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rp1P56716 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rp1P56716 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rp1P56716 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rp1P56716 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rp1P56716 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rp1P56716 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rp1P56716 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rp1P56716 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms