Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sh3bp1P55194 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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