Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NcanP55066 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NcanP55066 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcanP55066 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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