Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb3P54754 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms