Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cacnb3P54285 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacnb3P54285 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms