Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Upp1P52624 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms