Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ube2e3P52483 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms