Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apobec1P51908 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms