Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Defa6P50704 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa6P50704 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms