Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
TspoP50637 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TspoP50637 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TspoP50637 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TspoP50637 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms