Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SftpbP50405 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SftpbP50405 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SftpbP50405 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpbP50405 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpbP50405 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SftpbP50405 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SftpbP50405 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SftpbP50405 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SftpbP50405 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SftpbP50405 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms