Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpdP50404 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpdP50404 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpdP50404 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpdP50404 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SftpdP50404 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SftpdP50404 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms