Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl13P47963 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpl13P47963 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms