Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scg3P47867 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scg3P47867 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Scg3P47867 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scg3P47867 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg3P47867 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg3P47867 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scg3P47867 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg3P47867 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg3P47867 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scg3P47867 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg3P47867 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg3P47867 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scg3P47867 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg3P47867 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms