Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrprbP47758 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SrprbP47758 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms