Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klf1P46099 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf1P46099 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms