Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nkx1-2P42580 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms