Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept1P42209 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sept1P42209 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sept1P42209 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms