Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LtbP41155 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LtbP41155 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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LtbP41155 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LtbP41155 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LtbP41155 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LtbP41155 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LtbP41155 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LtbP41155 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LtbP41155 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LtbP41155 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LtbP41155 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LtbP41155 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LtbP41155 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LtbP41155 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LtbP41155 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LtbP41155 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LtbP41155 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LtbP41155 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms