Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fen1P39749 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fen1P39749 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fen1P39749 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fen1P39749 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms