Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtlP38585 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtlP38585 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TtlP38585 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TtlP38585 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TtlP38585 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TtlP38585 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TtlP38585 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TtlP38585 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
TtlP38585 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TtlP38585 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TtlP38585 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TtlP38585 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TtlP38585 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TtlP38585 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TtlP38585 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TtlP38585 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtlP38585 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtlP38585 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms