Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HmgclP38060 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HmgclP38060 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HmgclP38060 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HmgclP38060 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HmgclP38060 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HmgclP38060 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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HmgclP38060 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HmgclP38060 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HmgclP38060 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HmgclP38060 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HmgclP38060 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HmgclP38060 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HmgclP38060 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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HmgclP38060 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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