Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpardP35396 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpardP35396 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpardP35396 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpardP35396 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpardP35396 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PpardP35396 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PpardP35396 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpardP35396 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpardP35396 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpardP35396 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms