Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab23P35288 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab23P35288 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms