Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ptk2P34152 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptk2P34152 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms